卵の中に褐色のかたまりは、「ミートスポット」といって、卵の形成過程で卵殻の色の元になる粒子が集合して、卵の中に入ったものです。

常に一定の確率で発生し、特に赤玉に多く見られます。

鶏の体内で作られた色素ですので、そのまま食べても問題ありません。